A disciplina de Educação Física no CMDP II tem seu início na Educação Infantil, onde os professores trabalham a organização da motricidade dos alunos por meio da ludicidade e a interatividade, tendo como um dos mais importantes fatores a socialização, que visa desenvolver aspectos sociais como convivência em grupo e a interação entre os alunos.
No Ensino Fundamental I (2º ao 5º), os profissionais procuram incentivar a prática desportiva, bem como desenvolver os fundamentos psicomotores e as possibilidades expressivas do movimento, além das habilidades básicas motoras fundamentais (correr, saltar, andar, lançar, etc.) Por meio de jogos e brincadeiras lúdicas, a fim de desenvolver a criança de forma integral, nas dimensões motora, cognitiva, afetiva e social.

A partir do Ensino Fundamental II (6º ao 9º) e Ensino Médio, os alunos vivenciam atividades propostas pelo professor que são compostas por várias atividades como: esportes englobando as principais modalidades coletivas, jogos, danças, lutas e a atividade de salvamento aquático oferecida aos alunos da 2ª série do Ensino Médio.

Entre as atividades propostas para a parte do desporto, contamos com as equipes de voleibol, handebol e futsal, que representam o CMDP em competições oficiais durante o ano letivo, formadas através da “peneira” (seleção dos alunos em data definida que apresentam as melhores habilidades dentro das modalidades) com rotina semanal de treinos no contra turno e as ESCOLINHAS DE ESPORTES DOM PEDRO, projeto com a participação de profissionais terceirizados que oferece aos alunos interessados as modalidades de patinação, ginástica rítmica e acrobática, futsal e natação duas vezes por semana com o custo de mensalidade estipulada em contrato cobrada ao responsável a partir da matrícula do aluno.

Com o objetivo de interação entre os segmentos e promoção do senso competitivo saudável, amigável e prazeroso entre os alunos através de competições esportivas, a escola junto com a Seção de Educação Física promove os JOGOS OLÍMPICOS DO CMDPII, evento que acontece na última semana do 1º semestre letivo promovendo competições dentro do segmento em diversas modalidades esportivas coletivas e individuais, finalizando com a solenidade de premiação com troféu e medalhas para as três primeiras equipes a somarem maior número de pontos durante a competição. Temos ainda as ações sociais realizadas pela seção como o Festvôlei e o festival de futsal, eventos organizados pelos professores que arrecadam alimentos e produtos de higiene pessoal com taxa de inscrição das equipes que ao final são doados a instituições carentes.

O quadro de profissionais da Seção de Educação Física do CMDPII, atualmente é composto por oito professores militares e dois funcionários civis distribuídos nos turnos matutino e vespertino, um oficial chefe da seção e dois coordenadores pedagógicos por período de acordo com a tabela abaixo: